实时荧光定量聚合酶链反应检测沙眼衣原体等病原体感染
在性传播疾病中,淋病奈瑟菌(Ng)、沙眼衣原体(Ct)、解脲脲原体(Uu)感染较常见。我们采用实时荧光定量聚合酶链反应(FQ-PCR)方法[1]对其进行检测,取得了较好效果,报告如下。
一、材料和方法
1.标本来源及取材方法:标本均由本院临床科室从疑有Ng、Ct、Uu感染的患者,取其宫颈、尿道分泌物送检。共检测标本3 346份,其中Ng 1 416份、Ct 1 165份、Uu 765份。取材方法:用消毒棉签插入宫颈口或尿道口捻转并停留数秒。如果男性患者尿道口分泌物过少,则取前列腺液2~3滴。
2.仪器和试剂盒:仪器为美国PE 7700自动荧光PCR仪,FQ-PCR Ng、Ct、Uu试剂盒均为广州中山医科大学达安基因诊断中心产品。
3.试剂盒使用方法:将标本洗涤液12 000 r/min离心5 min,去上清液,采用常规碱裂解法提取Ng、Ct、Uu-DNA。各反应管放入PE7700自动荧光检测仪,按下列条件扩增:93℃5 min预变性,然后按93℃45 s~55℃120 s。共做40个循环。反应结束后,由电脑自动分析计算出定量结果。每批Ng、Ct、Uu试剂盒,均做定量阳性质控。每次检测均做阳性和阴性对照。统计学处理:采用χ2检验。
二、结果
Ng、Ct、Uu的定量阳性质控标准品经FQ-PCR,以起始拷贝数的自然对数为横坐标,以循环阈值为纵坐标,得到一条直线型标准曲线,斜率为-3.4,线性相关系数r>0.98。
FQ-PCR检测Ng-DNA 1 416份,阳性368份,阳性率26%,阳性标本定量对数平均值:2.3×106。检测Ct-DNA 1 165份,阳性315份,阳性率27%,阳性标本定量对数平均值:8.5×105。检测Uu-DNA 765份,阳性279份,阳性率36.5%,阳性标本定量对数平均值:2.4×104。Uu-DNA检出的阳性率与Ng-DNA、Ct-DNA的阳性率相比,差异有高度显著性(χ2=28.57、P<0.005)。
三、讨论
我们采用的实时FQ-PCR技术。利用了基因扩增的灵敏性,分子杂交的特异性和光化学的精确性[2,3],从根本上解决了PCR扩增产物污染和不能定量的问题。与竞争性PCR、PCR-EILA等定量PCR相比[4],荧光定量PCR除了有快速、操作简便,无需对PCR产物进行后处理,还具有定量范围宽、定量准确等优点。特别是PE 7700自动荧光PCR仪,采用激光光源,实时定量检测技术。所检测的循环阈值(Ct值)和原始模板数量完全呈线性相关,定量准确。还可为临床考评疗效提供依据。
参考文献
1 程钢,何蕴韶,周新宇.荧光定量聚合酶链反应检测乙型肝炎病毒.中华医学检验杂志,1999,22:135-138.
2 Gibson, Heid C A, Williams P M. A novel method for real time quantitative RT-PCR. Genome Res, 1996, 6: 995-1001.
3 Heid C A, Stevens J, Livak K J, et al. Real time quantitative PCR. Genome Res, 1996, 6: 986-994.
4 Desjardin L E, Chen Y, Perkins M D, et al. Comparison of the ABI 7700 system (TaqMan) and competitive PCR for quantification of IS6110 DNA in sputum during treatment of tuberculosis. J Clin Microbil, 1998, 36: 1964-1968.
