关键词:
大肠埃希菌;环丙沙星;gyrA基因;突变 【
摘要
】
目的
了解临床分离大肠埃希菌耐环丙沙星gyrA基因突变情况。
方法
用环丙沙星浓度梯度法试条检测临床分离大肠埃希菌最低抑菌浓度(MIC),聚合酶链反应(PCR)扩增gyrA基因喹诺酮耐药决定区,扩增产物片段长度为668 bp,用限制性内切酶HinfⅠ消化PCR产物,行8%聚丙烯酰胺凝胶电泳。
结果
共检测大肠埃希菌41株,14株MIC在0.25~0.5 μg/ml的菌株,未检出耐药性突变位点;4株MIC在1~2 μg/ml的菌株(2株MIC为1μg/ml、1株为1.5 μg/ml,1株为2 μg/ml)均出现gyrA基因突变;耐药菌23株(1株MIC为16 μg/ml,其余≥32 μg/ml)也均发生gyrA基因突变。
结论
临床分离大肠埃希菌对环丙沙星耐药性与HinfⅠ酶切位点突变密切相关,低水平耐药菌株gyrA基因发生突变具有一定临床意义。
A gyrA gene mutation in clinical Escherichia coli
Zhang Junmin, Wu Jian, Zhao Liping, et al. Department of Microbiology, the General Hospital of PLA, Beijing 100853 【
Abstract
】
Objective
To study a gyrA mutation of clinical E.coli strains.
Methods
We used Ciprofloxacin Etest to detect the MIC values of clinical E.coli strains, then PCR to amplify the quinolone-determining region (QRDR) of the gyrA gene, and digest the PCR products (668 bp) with HinfⅠ and 8% polyacrylamide gel electrophoresis.
Results
Fourty-one strains of E.coli were detected. Fourteen strains with MIC 0.25~0.5 μg/ml exhibited no gyrA mutation, but 4 strains with MIC 1~2 μg/ml and 23 strains with MIC 16~23 μg/ml gyrA gene mutation.
Conclusion
There was a close relationship between the clinical quinolone-resistant E.coli strains and the loss of HinfⅠ sits in gyrA gene. The gyrA gene mutation found in low-level Ciprofloxacin resistant E. coli will be useful to manage these resistant strains. 【
Key words
】 E.coli Ciprofloxacin gyrA gene Mutation 近年来临床分离大肠埃希菌对喹诺酮类耐药性的显著上升趋势,引起了临床和微生物实验室的广泛关注。编码DNA旋转酶的gyrA或gyrB基因发生点突变被认为是产生耐药性的主要原因
[1]。用聚合酶链反应(PCR)-限制性内切酶片段长度多态性(RFLP)检测大肠埃希菌gyrA基因突变位点,是一种简便、易行的方法
[2]。为此,我们利用此方法对临床分离大肠埃希菌gyrA基因突变情况进行了研究,现将结果报告如下。
材料与方法
一、材料
1.菌株:临床分离大肠埃希菌41株:23株为耐药菌,其中1株环丙沙星最低抑菌浓度(MIC)为16 μg/ml,其余22株MIC≥32 μg/ml;2株MIC分别为1.5 μg/ml和2 μg/ml;敏感菌16株,其中14株MIC在0.25~0.5 μg/ml,2株MIC为1μg/ml。同时也检测大肠埃希菌ATCC 25922。
2.环丙沙星浓度梯度法试条、药敏用培养基均为AB Biodisk产品。试条MIC结果按美国临床试验室标准化委员会1996年标准判断。环丙沙星MIC≤1μg/ml为敏感,MIC≥4μg/ml为耐药。
二、方法
1.DNA提取:按文献[3]进行,不做RNA消化,DNA溶于0.5ml TE缓冲液中待用。
2.PCR反应扩增:喹诺酮耐药决定区(QRDR)引物按文献[2],引物1为5′-GAGGAAGAGCTGAAGAGCTCCT-3′,引物2为5′-CCGGTACGGTAAG-CTTCTTCAA-3′,由中国科学院微生物研究所基因工程中心合成。PCR体积25 μl:Tris-HCl 10 mmol/L,pH9.0、KCl 50 mmol/L、MgCl2 2.5 mmol/L、Triton X-100 0.1%、4×dNTPs各200 μmol/L北京宝秦克生物科技公司产品;引物0.5 μmol/L、Taq DNA聚合酶1UPromega公司产品。DNA模板5 μl。93℃预变性5分钟,93℃1分钟、55℃1分钟、72℃2分钟,共40个循环。最后72℃再延伸6分钟。1.5%琼脂糖凝胶电泳。
3.HinfⅠ酶切分析:方法按文献[4]进行,反应总体积20 μl:2 μl 10×反应缓冲液、10 μl PCR扩增产物、6 μl无菌水、2 μl HinfⅠ限制性内切酶(6U/μl,北京北方同正生物技术发展公司产品),8 000 r/min离心30秒,放37℃作用4小时,取10 μl消化产物行8%聚丙烯酰胺凝胶电泳,150V电压1.5小时。放含0.5 μg/ml溴化乙啶的1×TBE缓冲液染色30分钟,观察结果并照相。
结果
用PCR方法对41株大肠埃希菌及大肠埃希菌ATCC 25922QRDR进行扩增,经1.5%琼脂糖凝胶电泳证实,均扩增出一条片段长度为668 bp的产物。
对上述扩增产物用限制性内切酶HinfⅠ消化后行8%聚丙烯酰胺凝胶电泳,结果见附图。电泳结果显示环丙沙星MIC在0.25~0.5 μg/ml的大肠埃希菌及标准菌株,酶切后均为3条DNA带,表明这些菌株的HinfⅠ酶切位点未发生突变;而2株MIC为1 μg/ml的菌株、2株中介度的菌株以及所有耐药菌株,HinfⅠ酶切后则为2条DNA带,表明该酶切位