SARS的病原及全基因序列
作者：coolautumn
SARS是一种新的急性传染性疾病，病原、传播以及成因都是未知数。自发现SARS以来，医务工作都就紧张的寻找病原。刚开始所有非典型肺炎的病原（军团菌、衣原体、微球菌以及病毒等）都曾被怀疑，军团菌、微球菌逐渐被排除。从香港、中国大陆以及加拿大等地实验室陆续从患者体内检测出人类间质肺病毒(metapneumovirus, paramyxoviridae副黏液病毒科)、衣原体以及冠状病毒（coronavirus）。对于SARS的病原一时众说纷纭。
最近，德国、加拿大、美国科学家使用更多方法检验了以上三种病原的可能性，最终确认一种新的冠状病毒与SARS密切相关，推测它是致病的元凶。最权威的临床学术刊物《新英格兰杂志》于十日刊登了最新研究成果，各国科学家拿出的结果惊人的相似，近似于100%的相同，在对新病毒测序中，全长30000个碱基只有100多不同，显示目前病毒以很稳定的存在环境中。
近日中国科学院院士洪涛也认同新的冠状病毒是致病元凶。但同时坚持SARS是多病原体引起的，衣原体也是其中重要的一种。
病毒发现历程：
首先各自收集亚洲地区为主的SARS检体样本进行已知的病源测试，在这一部份大多数的检体都呈现阴性，显示这是由新的病源所引起。
接着他们将病源进行的活体外培养，美国科学家使用了芯片技术与所有病毒进行杂交，发现与冠状病毒最近，而以后的测序也验证了这一点。这个结论与德、加等国的研究成果完全一致。
新病毒的特点：
冠状病毒的出现最令科学家惊讶，因为依据过去的了解冠状病毒对人造成危害的例子不多，唯一与呼吸道疾病有关的症状并不像SARS这么严重，而且基因序列也有极大的差异。国际SARS研究团队在发现新种冠状病毒之后，旋即以血清学分析、免疫组织染色、PCR等方法检查手中现有的检体，在18个检体中果真有一种以上的方法呈现阳性，证实新种冠状病毒与SARS的相关。另外德国科学家则是实时定量PCR的方法(real-time PCR)来侦测病毒的存在与数目，经过试验可以区分冠状病毒在SARS可能患者与健康对照的有无。
病毒来源：
依据新种冠状病毒与已知冠状病毒的演化树分布，SARS-冠状病毒应该是变种而来，如果能了解病毒的来源，或许就能更了解新种冠状病毒的传染机制与传播途径。另外，依据柯霍氏法则(Koch’s postulates)，在SARS患者上发现冠状病毒的存在仅能说明两者有关系，但未必就确定新种冠状病毒就是元凶，研究团队还需要更多的实验才能确认新种冠状病毒是SARS的病源。
荷兰Utrecht大学的Peter Rottier说。Rottier的研究小组通过向猫细胞导入传染性猫腹脑炎病毒（feline infectious peritonitis virus，FIPV）创造出这种新冠状病毒。FIPV是一种常见病原体，5％的猫都是死于该病毒。研究人员给FIPV导入小鼠冠状病毒的一个基因片段，该基因编码一种外壳蛋白可以识别并帮助穿透小鼠细胞。 几个小时后，猫FIPV病毒的一些病毒粒子的外壳蛋白基因变成了小鼠的外壳基因，因而可以感染小鼠细胞了。如果两种蛋白同时感染同一细胞就可能发生这种情况。 这个结果支持了SARS冠状病毒可能是在动物和人类病毒相遇，发生基因交换时产生的观点，也提示了病源来源于动物的可能。同时这项研究也证明了一个同怕的问题：冠状病毒通过基因改变能够轻易地改变感染宿主。
由于冠状病毒能够很容易的与动物或其它病毒发生基因转移性重组，因此理论上生物恐怖分子可以利用这一技术制造出危害性更大的新病源。但科技总是双刃剑，利用这一技术也可以制造出保护性疫苗。Rottier的研究小组已开始研制抗冠状病毒的活疫苗。他们筛选了感染小鼠的FIPV中由于基因交换变为无毒的病毒株。他们发现，用这些病毒株中的一种结种猫，可以防止猫感染上原始的致命FIPV。
最新检测方法：
病毒的基因序列已经确定，所以RT－PCR是检测病毒最快的也是最好的方法。德国汉堡的一家公司已经开发出该病毒的实时荧光定量检测试剂。
附，基因序列
1 atattaggtt tttacctacc caggaaaagc caaccaacct cgatctcttg tagatctgtt
61 ctctaaacga actttaaaat ctgtgtagct gtcgctcggc tgcatgccta gtgcacctac
121 gcagtataaa caataataaa ttttactgtc gttgacaaga aacgagtaac tcgtccctct
181 tctgcagact gcttacggtt tcgtccgtgt tgcagtcgat catcagcata cctaggtttc
241 gtccgggtgt gaccgaaagg taagatggag agccttgttc ttggtgtcaa cgagaaaaca
301 cacgtccaac tcagtttgcc tgtccttcag gttagagacg tgctagtgcg tggcttcggg
361 gactctgtgg aagaggccct atcggaggca cgtgaacacc tcaaaaatgg cacttgtggt
421 ctagtagagc tggaaaaagg cgtactgccc cagcttgaac agccctatgt gttcattaaa
481 cgttctgatg ccttaagcac caatcacggc cacaaggtcg ttgagctggt tgcagaaatg
541 gacggcattc agtacggtcg tagcggtata acactgggag tactcgtgcc acatgtgggc
601 gaaaccccaa ttgcataccg caatgttctt cttcgtaaga acggtaataa gggagccggt
661 ggtcatagct atggcatcga tctaaagtct tatgacttag gtgacgagct tggcactgat
721 cccattgaag attatgaaca aaactggaac actaagcatg gcagtggtgc actccgtgaa
781 ctcactcgtg agctcaatgg aggtgcagtc actcgctatg tcgacaacaa tttctgtggc
841 ccagatgggt accctcttga ttgcatcaaa gattttctcg cacgcgcggg caagtcaatg
901 tgcactcttt ccgaacaact tgattacatc gagtcgaaga gaggtgtcta ctgctgccgt
961 gaccatgagc atgaaattgc ctggttcact gagcgctctg ataagagcta cgagcaccag
1021 acacccttcg aaattaagag tgccaagaaa tttgacactt tcaaagggga atgcccaaag
1081 tttgtgtttc ctcttaactc aaaagtcaaa gtcattcaac cacgtgttga aaagaaaaag
1141 actgagggtt tcatggggcg tatacgctct gtgtaccctg ttgcatctcc acaggagtgt
1201 aacaatatgc acttgtctac cttgatgaaa tgtaatcatt gcgatgaagt ttcatggcag
1261 acgtgcgact ttctgaaagc cacttgtgaa cattgtggca ctgaaaattt agttattgaa
1321 ggacctacta catgtgggta cctacctact aatgctgtag tgaaaatgcc atgtcctgcc
1381 tgtcaagacc cagagattgg acctgagcat agtgttgcag attatcacaa ccactcaaac
1441 attgaaactc gactccgcaa gggaggtagg actagatgtt ttggaggctg tgtgtttgcc
1501 tatgttggct gctataataa gcgtgcctac tgggttcctc gtgctagtgc tgatattggc
1561 tcaggccata ctggcattac tggtgacaat gtggagacct tgaatgagga tctccttgag
1621 atactgagtc gtgaacgtgt taacattaac attgttggcg attttcattt gaatgaagag
1681 gttgccatca ttttggcatc tttctctgct tctacaagtg cctttattga cactataaag
1741 agtcttgatt acaagtcttt caaaaccatt gttgagtcct gcggtaacta taaagttacc
1801 aagggaaagc ccgtaaaagg tgcttggaac attggacaac agagatcagt tttaacacca
1861 ctgtgtggtt ttccctcaca ggctgctggt gttatcagat caatttttgc gcgcacactt
1921 gatgcagcaa accactcaat tcctgatttg caaagagcag ctgtcaccat acttgatggt
1981 atttctgaac agtcattacg tcttgtcgac gccatggttt atacttcaga cctgctcacc
2041 aacagtgtca ttattatggc atatgtaact ggtggtcttg tacaacagac ttctcagtgg
2101 ttgtctaatc ttttgggcac tactgttgaa aaactcaggc ctatctttga atggattgag
2161 gcgaaactta gtgcaggagt tgaatttctc aaggatgctt gggagattct caaatttctc
2221 attacaggtg tttttgacat cgtcaagggt caaatacagg ttgcttcaga taacatcaag
2281 gattgtgtaa aatgcttcat tgatgttgtt aacaaggcac tcgaaatgtg cattgatcaa
2341 gtcactatcg ctggcgcaaa gttgcgatca ctcaacttag gtgaagtctt catcgctcaa
2401 agcaagggac tttaccgtca gtgtatacgt ggcaaggagc agctgcaact actcatgcct
2461 cttaaggcac caaaagaagt aacctttctt gaaggtgatt cacatgacac agtacttacc
2521 tctgaggagg ttgttctcaa gaacggtgaa ctcgaagcac tcgagacgcc cgttgatagc
2581 ttcacaaatg gagctatcgt tggcacacca gtctgtgtaa atggcctcat gctcttagag
2641 attaaggaca aagaacaata ctgcgcattg tctcctggtt tactggctac aaacaatgtc
2701 tttcgcttaa aagggggtgc accaattaaa ggtgtaacct ttggagaaga tactgtttgg
2761 gaagttcaag gttacaagaa tgtgagaatc acatttgagc ttgatgaacg tgttgacaaa
2821 gtgcttaatg aaaagtgctc tgtctacact gttgaatccg gtaccgaagt tactgagttt
2881 gcatgtgttg tagcagaggc tgttgtgaag actttacaac cagtttctga tctccttacc
2941 aacatgggta ttgatcttga tgagtggagt gtagctacat tctacttatt tgatgatgct
3001 ggtgaagaaa acttttcatc acgtatgtat tgttcctttt accctccaga tgaggaagaa
3061 gaggacgatg cagagtgtga ggaagaagaa attgatgaaa cctgtgaaca tgagtacggt
3121 acagaggatg attatcaagg tctccctctg gaatttggtg cctcagctga aacagttcga
3181 gttgaggaag aagaagagga agactggctg gatgatacta ctgagcaatc agagattgag
3241 ccagaaccag aacctacacc tgaagaacca gttaatcagt ttactggtta tttaaaactt
3301 actgacaatg ttgccattaa atgtgttgac atcgttaagg aggcacaaag tgctaatcct
3361 atggtgattg taaatgctgc taacatacac ctgaaacatg gtggtggtgt agcaggtgca
3421 ctcaacaagg caaccaatgg tgccatgcaa aaggagagtg atgattacat taagctaaat
3481 ggccctctta cagtaggagg gtcttgtttg ctttctggac ataatcttgc taagaagtgt
3541 ctgcatgttg ttggacctaa cctaaatgca ggtgaggaca tccagcttct taaggcagca
3601 tatgaaaatt tcaattcaca ggacatctta cttgcaccat tgttgtcagc aggcatattt
3661 ggtgctaaac cacttcagtc tttacaagtg tgcgtgcaga cggttcgtac acaggtttat
3721 attgcagtca atgacaaagc tctttatgag caggttgtca tggattatct tgataacctg
3781 aagcctagag tggaagcacc taaacaagag gagccaccaa acacagaaga ttccaaaact
3841 gaggagaaat ctgtcgtaca gaagcctgtc gatgtgaagc caaaaattaa ggcctgcatt
3901 gatgaggtta ccacaacact ggaagaaact aagtttctta ccaataagtt actcttgttt
3961 gctgatatca atggtaagct ttaccatgat tctcagaaca tgcttagagg tgaagatatg
4021 tctttccttg agaaggatgc accttacatg gtaggtgatg ttatcactag tggtgatatc
4081 acttgtgttg taataccctc caaaaaggct ggtggcacta ctgagatgct ctcaagagct
4141 ttgaagaaag tgccagttga tgagtatata accacgtacc ctggacaagg atgtgctggt
4201 tatacacttg aggaagctaa gactgctctt aagaaatgca aatctgcatt ttatgtacta
4261 ccttcagaag cacctaatgc taaggaagag attctaggaa ctgtatcctg gaatttgaga
4321 gaaatgcttg ctcatgctga agagacaaga aaattaatgc ctatatgcat ggatgttaga
4381 gccataatgg caaccatcca acgtaagtat aaaggaatta aaattcaaga gggcatcgtt
4441 gactatggtg tccgattctt cttttatact agtaaagagc ctgtagcttc tattattacg
4501 aagctgaact ctctaaatga gccgcttgtc acaatgccaa ttggttatgt gacacatggt
4561 tttaatcttg aagaggctgc gcgctgtatg cgttctctta aagctcctgc cgtagtgtca
4621 gtatcatcac cagatgctgt tactacatat aatggatacc tcacttcgtc atcaaagaca
4681 tctgaggagc actttgtaga aacagtttct ttggctggct cttacagaga ttggtcctat
4741 tcaggacagc gtacagagtt aggtgttgaa tttcttaagc gtggtgacaa aattgtgtac
4801 cacactctgg agagccccgt cgagtttcat cttgacggtg aggttctttc acttgacaaa
4861 ctaaagagtc tcttatccct gcgggaggtt aagactataa aagtgttcac aactgtggac
4921 aacactaatc tccacacaca gcttgtggat atgtctatga catatggaca gcagtttggt
4981 ccaacatact tggatggtgc tgatgttaca aaaattaaac ctcatgtaaa tcatgagggt
5041 aagactttct ttgtactacc tagtgatgac acactacgta gtgaagcttt cgagtactac
5101 catactcttg atgagagttt tcttggtagg tacatgtctg ctttaaacca cacaaagaaa
5161 tggaaatttc ctcaagttgg tggtttaact tcaattaaat gggctgataa caattgttat
5221 ttgtctagtg ttttattagc acttcaacag cttgaagtca aattcaatgc accagcactt
5281 caagaggctt attatagagc ccgtgctggt gatgctgcta acttttgtgc actcatactc
5341 gcttacagta ataaaactgt tggcgagctt ggtgatgtca gagaaactat gacccatctt
5401 ctacagcatg ctaatttgga atctgcaaag cgagttctta atgtggtgtg taaacattgt
5461 ggtcagaaaa ctactacctt aacgggtgta gaagctgtga tgtatatggg tactctatct
5521 tatgataatc ttaagacagg tgtttccatt ccatgtgtgt gtggtcgtga tgctacacaa
5581 tatctagtac aacaagagtc ttcttttgtt atgatgtctg caccacctgc tgagtataaa
5641 ttacagcaag gtacattctt atgtgcgaat gagtacactg gtaactatca gtgtggtcat
5701 tacactcata taactgctaa ggagaccctc tatcgtattg acggagctca ccttacaaag
5761 atgtcagagt acaaaggacc agtgactgat gttttctaca aggaaacatc ttacactaca
5821 accatcaagc ctgtgtcgta taaactcgat ggagttactt acacagagat tgaaccaaaa
5881 ttggatgggt attataaaaa ggataatgct tactatacag agcagcctat agaccttgta
5941 ccaactcaac cattaccaaa tgcgagtttt gataatttca aactcacatg ttctaacaca
6001 aaatttgctg atgatttaaa tcaaatgaca ggcttcacaa agccagcttc acgagagcta
6061 tctgtcacat tcttcccaga cttgaatggc gatgtagtgg ctattgacta tagacactat
6121 tcagcgagtt tcaagaaagg tgctaaatta ctgcataagc caattgtttg gcacattaac
6181 caggctacaa ccaagacaac gttcaaacca aacacttggt gtttacgttg tctttggagt
6241 acaaagccag tagatacttc aaattcattt gaagttctgg cagtagaaga cacacaagga
6301 atggacaatc ttgcttgtga aagtcaacaa cccacctctg aagaagtagt ggaaaatcct
6361 accatacaga aggaagtcat agagtgtgac gtgaaaacta ccgaagttgt aggcaatgtc
6421 atacttaaac catcagatga aggtgttaaa gtaacacaag agttaggtca tgaggatctt
6481 atggctgctt atgtggaaaa cacaagcatt accattaaga aacctaatga gctttcacta
6541 gccttaggtt taaaaacaat tgccactcat ggtattgctg caattaatag tgttccttgg
6601 agtaaaattt tggcttatgt caaaccattc ttaggacaag cagcaattac aacatcaaat
6661 tgcgctaaga gattagcaca acgtgtgttt aacaattata tgccttatgt gtttacatta
6721 ttgttccaat tgtgtacttt tactaaaagt accaattcta gaattagagc ttcactacct
6781 acaactattg ctaaaaatag tgttaagagt gttgctaaat tatgtttgga tgccggcatt
6841 aattatgtga agtcacccaa attttctaaa ttgttcacaa tcgctatgtg gctattgttg
6901 ttaagtattt gcttaggttc tctaatctgt gtaactgctg cttttggtgt actcttatct
6961 aattttggtg ctccttctta ttgtaatggc gttagagaat tgtatcttaa ttcgtctaac
7021 gttactacta tggatttctg tgaaggttct tttccttgca gcatttgttt aagtggatta
7081 gactcccttg attcttatcc agctcttgaa accattcagg tgacgatttc atcgtacaag
7141 ctagacttga caattttagg tctggccgct gagtgggttt tggcatatat gttgttcaca
7201 aaattctttt atttattagg tctttcagct ataatgcagg tgttctttgg ctattttgct
7261 agtcatttca tcagcaattc ttggctcatg tggtttatca ttagtattgt acaaatggca
7321 cccgtttctg caatggttag gatgtacatc ttctttgctt ctttctacta catatggaag
7381 agctatgttc atatcatgga tggttgcacc tcttcgactt gcatgatgtg ctataagcgc
7441 aatcgtgcca cacgcgttga gtgtacaact attgttaatg gcatgaagag atctttctat
7501 gtctatgcaa atggaggccg tggcttctgc aagactcaca attggaattg tctcaattgt
7561 gacacatttt gcactggtag tacattcatt agtgatgaag ttgctcgtga tttgtcactc
7621 cagtttaaaa gaccaatcaa ccctactgac cagtcatcgt atattgttga tagtgttgct
7681 gtgaaaaatg gcgcgcttca cctctacttt gacaaggctg gtcaaaagac ctatgagaga
7741 catccgctct cccattttgt caatttagac aatttgagag ctaacaacac taaaggttca
7801 ctgcctatta atgtcatagt ttttgatggc aagtccaaat gcgacgagtc tgcttctaag
7861 tctgcttctg tgtactacag tcagctgatg tgccaaccta ttctgttgct tgaccaagtt
7921 cttgtatcag acgttggaga tagtactgaa gtttccgtta agatgtttga tgcttatgtc
7981 gacacctttt cagcaacttt tagtgttcct atggaaaaac ttaaggcact tgttgctaca
8041 gctcacagcg agttagcaaa gggtgtagct ttagatggtg tcctttctac attcgtgtca
8101 gctgcccgac aaggtgttgt tgataccgat gttgacacaa aggatgttat tgaatgtctc
8161 aaactttcac atcactctga cttagaagtg acaggtgaca gttgtaacaa tttcatgctc
8221 acctataata aggttgaaaa catgacgccc agagatcttg gcgcatgtat tgactgtaat
8281 gcaaggcata tcaatgccca agtagcaaaa agtcacaatg tttcactcat ctggaatgta
8341 aaagactaca tgtctttatc tgaacagctg cgtaaacaaa ttcgtagtgc tgccaagaag
8401 aacaacatac cttttagact aacttgtgct acaactagac aggttgtcaa tgtcataact
8461 actaaaatct cactcaaggg tggtaagatt gttagtactt gttttaaact tatgcttaag
8521 gccacattat tgtgcgttct tgctgcattg gtttgttata tcgttatgcc agtacataca
8581 ttgtcaatcc atgatggtta cacaaatgaa atcattggtt acaaagccat tcaggatggt
8641 gtcactcgtg acatcatttc tactgatgat tgttttgcaa ataaacatgc tggttttgac
8701 gcatggttta gccagcgtgg tggttcatac aaaaatgaca aaagctgccc tgtagtagct
8761 gctatcatta caagagagat tggtttcata gtgcctggct taccgggtac tgtgctgaga
8821 gcaatcaatg gtgacttctt gcattttcta cctcgtgttt ttagtgctgt tggcaacatt
8881 tgctacacac cttccaaact cattgagtat agtgattttg ctacctctgc ttgcgttctt
8941 gctgctgagt gtacaatttt taaggatgct atgggcaaac ctgtgccata ttgttatgac
9001 actaatttgc tagagggttc tatttcttat agtgagcttc gtccagacac tcgttatgtg
9061 cttatggatg gttccatcat acagtttcct aacacttacc tggagggttc tgttagagta
9121 gtaacaactt ttgatgctga gtactgtaga catggtacat gcgaaaggtc agaagtaggt
9181 atttgcctat ctaccagtgg tagatgggtt cttaataatg agcattacag agctctatca
9241 ggagttttct gtggtgttga tgcgatgaat ctcatagcta acatctttac tcctcttgtg
9301 caacctgtgg gtgctttaga tgtgtctgct tcagtagtgg ctggtggtat tattgccata
9361 ttggtgactt gtgctgccta ctactttatg aaattcagac gtgtttttgg tgagtacaac
9421 catgttgttg ctgctaatgc acttttgttt ttgatgtctt tcactatact ctgtctggta
9481 ccagcttaca gctttctgcc gggagtctac tcagtctttt acttgtactt gacattctat
9541 ttcaccaatg atgtttcatt cttggctcac cttcaatggt ttgccatgtt ttctcctatt
9601 gtgccttttt ggataacagc aatctatgta ttctgtattt ctctgaagca ctgccattgg
9661 ttctttaaca actatcttag gaaaagagtc atgtttaatg gagttacatt tagtaccttc
9721 gaggaggctg ctttgtgtac ctttttgctc aacaaggaaa tgtacctaaa attgcgtagc
9781 gagacactgt tgccacttac acagtataac aggtatcttg ctctatataa caagtacaag
9841 tatttcagtg gagccttaga tactaccagc tatcgtgaag cagcttgctg ccacttagca
9901 aaggctctaa atgactttag caactcaggt gctgatgttc tctaccaacc accacagaca
9961 tcaatcactt ctgctgttct gcagagtggt tttaggaaaa tggcattccc gtcaggcaaa
10021 gttgaagggt gcatggtaca agtaacctgt ggaactacaa ctcttaatgg attgtggttg
10081 gatgacacag tatactgtcc aagacatgtc atttgcacag cagaagacat gcttaatcct
10141 aactatgaag atctgctcat tcgcaaatcc aaccatagct ttcttgttca ggctggcaat
10201 gttcaacttc gtgttattgg ccattctatg caaaattgtc tgcttaggct taaagttgat
10261 acttctaacc ctaagacacc caagtataaa tttgtccgta tccaacctgg tcaaacattt
10321 tcagttctag catgctacaa tggttcacca tctggtgttt atcagtgtgc catgagacct
10381 aatcatacca ttaaaggttc tttccttaat ggatcatgtg gtagtgttgg ttttaacatt
10441 gattatgatt gcgtgtcttt ctgctatatg catcatatgg agcttccaac aggagtacac
10501 gctggtactg acttagaagg taaattctat ggtccatttg ttgacagaca aactgcacag
10561 gctgcaggta cagacacaac cataacatta aatgttttgg catggctgta tgctgctgtt
10621 atcaatggtg ataggtggtt tcttaataga ttcaccacta ctttgaatga ctttaacctt
10681 gtggcaatga agtacaacta tgaacctttg acacaagatc atgttgacat attgggacct
10741 ctttctgctc aaacaggaat tgccgtctta gatatgtgtg ctgctttgaa agagctgctg
10801 cagaatggta tgaatggtcg tactatcctt ggtagcacta ttttagaaga tgagtttaca
10861 ccatttgatg ttgttagaca atgctctggt gttaccttcc aaggtaagtt caagaaaatt
10921 gttaagggca ctcatcattg gatgctttta actttcttga catcactatt gattcttgtt
10981 caaagtacac agtggtcact gtttttcttt gtttacgaga atgctttctt gccatttact
11041 cttggtatta tggcaattgc tgcatgtgct atgctgcttg ttaagcataa gcacgcattc
11101 ttgtgcttgt ttctgttacc ttctcttgca acagttgctt actttaatat ggtctacatg
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11701 gatgctttca agcttaacat taagttgttg ggtattggag gtaaaccatg tatcaaggtt
11761 gctactgtac agtctaaaat gtctgacgta aagtgcacat ctgtggtact gctctcggtt
11821 cttcaacaac ttagagtaga gtcatcttct aaattgtggg cacaatgtgt acaactccac
11881 aatgatattc ttcttgcaaa agacacaact gaagctttcg agaagatggt ttctcttttg
11941 tctgttttgc tatccatgca gggtgctgta gacattaata ggttgtgcga ggaaatgctc
12001 gataaccgtg ctactcttca ggctattgct tcagaattta gttctttacc atcatatgcc
12061 gcttatgcca ctgcccagga ggcctatgag caggctgtag ctaatggtga ttctgaagtc
12121 gttctcaaaa agttaaagaa atctttgaat gtggctaaat ctgagtttga ccgtgatgct
12181 gccatgcaac gcaagttgga aaagatggca gatcaggcta tgacccaaat gtacaaacag
12241 gcaagatctg aggacaagag ggcaaaagta actagtgcta tgcaaacaat gctcttcact
12301 atgcttagga agcttgataa tgatgcactt aacaacatta tcaacaatgc gcgtgatggt
12361 tgtgttccac tcaacatcat accattgact acagcagcca aactcatggt tgttgtccct
12421 gattatggta cctacaagaa cacttgtgat ggtaacacct ttacatatgc atctgcactc
12481 tgggaaatcc agcaagttgt tgatgcggat agcaagattg ttcaacttag tgaaattaac
12541 atggacaatt caccaaattt ggcttggcct cttattgtta cagctctaag agccaactca
12601 gctgttaaac tacagaataa tgaactgagt ccagtagcac tacgacagat gtcctgtgcg
12661 gctggtacca cacaaacagc ttgtactgat gacaatgcac ttgcctacta taacaattcg
12721 aagggaggta ggtttgtgct ggcattacta tcagaccacc aagatctcaa atgggctaga
12781 ttccctaaga gtgatggtac aggtacaatt tacacagaac tggaaccacc ttgtaggttt
12841 gttacagaca caccaaaagg gcctaaagtg aaatacttgt acttcatcaa aggcttaaac
12901 aacctaaata gaggtatggt gctgggcagt ttagctgcta cagtacgtct tcaggctgga
12961 aatgctacag aagtacctgc caattcaact gtgctttcct tctgtgcttt tgcagtagac
13021 cctgctaaag catataagga ttacctagca agtggaggac aaccaatcac caactgtgtg
13081 aagatgttgt gtacacacac tggtacagga caggcaatta ctgtaacacc agaagctaac
13141 atggaccaag agtcctttgg tggtgcttca tgttgtctgt attgtagatg ccacattgac
13201 catccaaatc ctaaaggatt ctgtgacttg aaaggtaagt acgtccaaat acctaccact
13261 tgtgctaatg acccagtggg ttttacactt agaaacacag tctgtaccgt ctgcggaatg
13321 tggaaaggtt atggctgtag ttgtgaccaa ctccgcgaac ccttgatgca gtctgcggat
13381 gcatcaacgt ttttaaacgg gtttgcggtg taagtgcagc ccgtcttaca ccgtgcggca
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13561 atttattaga ctcttacttt gtagttaaga ggcatactat gtctaactac caacatgaag
13621 agactattta taacttggtt aaagattgtc cagcggttgc tgtccatgac tttttcaagt
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13741 tggctgattt agtctatgct ctacgtcatt ttgatgaggg taattgtgat acattaaaag
13801 aaatactcgt cacatacaat tgctgtgatg atgattattt caataagaag gattggtatg
13861 acttcgtaga gaatcctgac atcttacgcg tatatgctaa cttaggtgag cgtgtacgcc
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14161 cacttattaa gtgggatttg ctgaaatatg attttacgga agagagactt tgtctcttcg
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14761 gtgatatcag acaactccta ttcgtagttg aagttgttga taaatacttt gattgttacg
14821 atggtggctg tattaatgcc aaccaagtaa tcgttaacaa tctggataaa tcagctggtt
14881 tcccatttaa taaatggggt aaggctagac tttattatga ctcaatgagt tatgaggatc
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15061 gtactatgac aaatagacag tttcatcaga aattattgaa gtcaatagcc gccactagag
15121 gagctactgt ggtaattgga acaagcaagt tttacggtgg ctggcataat atgttaaaaa
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15661 tgtgctataa cagtaactat gcggctcaag gtttagtagc tagcattaag aactttaagg
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16021 atttacaata cattagaaag ttacatgatg agcttactgg ccacatgttg gacatgtatt
16081 ccgtaatgct aactaatgat aacacctcac ggtactggga acctgagttt tatgaggcta
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16381 gcaagtcaca taagcctccc attagttttc cattatgtgc taatggtcag gtttttggtt
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16501 gtgattggac taatgctggc gattacatac ttgccaacac ttgtactgag agactcaagc
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17581 tcaaaatgtt ctacaaaggt gttattacac atgatgtttc atctgcaatc aacagacctc
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17881 ttttgtgcat aatgtctgat agagatcttt atgacaaact gcaatttaca agtctagaaa
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18061 taaagttcaa gactgaagga ttatgtgttg acataccagg cataccaaag gacatgacct
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18301 tttctacagg tgttaactta gtagctgtac cgactggtta tgttgacact gaaaataaca
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18421 cactcatgta taaaggcttg ccctggaatg tagtgcgtat taagatagta caaatgctca
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18841 attggtctgt tgaataccct attataggag atgaactgag ggttaattct gcttgcagaa
18901 aagtacaaca catggttgtg aagtctgcat tgcttgctga taagtttcca gttcttcatg
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19021 acgatgctca gccatgtagt gacaaagctt acaaaataga ggagctcttc tattcttatg
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19441 accgacagta cttggatgca tataatatga tgatttctgc tggatttagc ctatggattt
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20041 gagtcacatt aattggagaa tcagtaaaaa cacagtttaa ctactttaag aaagtagacg
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25261 cgaacttatg gatttgttta tgagattttt tactcttgga tcaattactg cacagccagt
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25741 accatataac agtgtcacag atacaattgt cgttactgaa ggtgacggca tttcaacacc
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25861 agactatgtc gttgtacatg gctatttcac cgaagtttac taccagcttg agtctacaca
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26161 tagcgtactt ctttttcttg ctttcgtggt attcttgcta gtcacactag ccatccttac
26221 tgcgcttcga ttgtgtgcgt actgctgcaa tattgttaac gtgagtttag taaaaccaac
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27181 agtgagacaa ttatttaagc ctctaactaa gaagaattat tcggagttag atgatgaaga
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27901 gtaatactta tagcactgct tggctttgtg ctctaggaaa ggttttacct tttcatagat
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28321 cctcgaggcc agggcgttcc aatcaacacc aatagtggtc cagatgacca aattggctac
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28861 actaagaaat ctgctgctga ggcatctaaa aagcctcgcc aaaaacgtac tgccacaaaa
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29161 aaagacaacg tcatactgct gaacaagcac attgacgcat acaaaacatt cccaccaaca
29221 gagcctaaaa aggacaaaaa gaaaaagact gatgaagctc agcctttgcc gcagagacaa
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29521 atctcacata gcaatcttta atcaatgtgt aacattaggg aggacttgaa agagccacca
29581 cattttcatc gaggccacgc ggagtacgat cgagggtaca gtgaataatg ctagggagag
29641 ctgcctatat ggaagagccc taatgtgtaa aattaatttt agtagtgcta tccccatgtg
29701 attttaatag cttcttagga gaatgac
,;ttgtccgtgg ttgggttttt ggttctacca tgaacaacaa gtcacagtcg gtgattatta
21841 ttaacaattc tactaatgtt gttatacgag catgtaactt tgaattgtgt gacaaccctt
21901 tctttgctgt ttctaaaccc atgggtacac agacacatac tatgatattc gataatgcat
21961 ttaattgcac tttcgagtac atatctgatg ccttttcgct tgatgtttca gaaaagtcag
22021 gtaattttaa acacttacga gagtttgtgt ttaaaaataa agatgggttt ctctatgttt
22081 ataagggcta tcaacctata gatgtagttc gtgatctacc ttctggtttt aacactttga
22141 aacctatttt taagttgcct cttggtatta acattacaaa ttttagagcc attcttacag
22201 ccttttcacc tgctcaagac atttggggca cgtcagctgc agcctatttt gttggctatt
22261 taaagccaac tacatttatg ctcaagtatg atgaaaatgg tacaatcaca gatgctgttg
22321 attgttctca aaatccactt gctgaactca aatgctctgt taagagcttt gagattgaca
22381 aaggaattta ccagacctct aatttcaggg ttgttccctc aggagatgtt gtgagattcc
22441 ctaatattac aaacttgtgt ccttttggag aggtttttaa tgctactaaa ttcccttctg
22501 tctatgcatg ggagagaaaa aaaatttcta attgtgttgc tgattactct gtgctctaca
22561 actcaacatt tttttcaacc tttaagtgct atggcgtttc tgccactaag ttgaatgatc
22621 tttgcttctc caatgtctat gcagattctt ttgtagtcaa gggagatgat gtaagacaaa
22681 tagcgccagg acaaactggt gttattgctg attataatta taaattgcca gatgatttca
22741 tgggttgtgt ccttgcttgg aatactagga acattgatgc tacttcaact ggtaattata
22801 attataaata taggtatctt agacatggca agcttaggcc ctttgagaga gacatatcta
22861 atgtgccttt ctcccctgat ggcaaacctt gcaccccacc tgctcttaat tgttattggc
22921 cattaaatga ttatggtttt tacaccacta ctggcattgg ctaccaacct tacagagttg
22981 tagtactttc ttttgaactt ttaaatgcac cggccacggt ttgtggacca aaattatcca
23041 ctgaccttat taagaaccag tgtgtcaatt ttaattttaa tggactcact ggtactggtg
23101 tgttaactcc ttcttcaaag agatttcaac catttcaaca atttggccgt gatgtttctg
23161 atttcactga ttccgttcga gatcctaaaa catctgaaat attagacatt tcaccttgct
23221 cttttggggg tgtaagtgta attacacctg gaacaaatgc ttcatctgaa gttgctgttc
23281 tatatcaaga tgttaactgc actgatgttt ctacagcaat tcatgcagat caactcacac
23341 cagcttggcg catatattct actggaaaca atgtattcca gactcaagca ggctgtctta
23401 taggagctga gcatgtcgac acttcttatg agtgcgacat tcctattgga gctggcattt
23461 gtgctagtta ccatacagtt tctttattac gtagtactag ccaaaaatct attgtggctt
23521 atactatgtc tttaggtgct gatagttcaa ttgcttactc taataacacc attgctatac
23581 ctactaactt ttcaattagc attactacag aagtaatgcc tgtttctatg gctaaaacct
23641 ccgtagattg taatatgtac atctgcggag attctactga atgtgctaat ttgcttctcc
23701 aatatggtag cttttgcaca caactaaatc gtgcactctc aggtattgct gctgaacagg
23761 atcgcaacac acgtgaagtg ttcgctcaag tcaaacaaat gtacaaaacc ccaactttga
23821 aatattttgg tggttttaat ttttcacaaa tattacctga ccctctaaag ccaactaaga
23881 ggtcttttat tgaggacttg ctctttaata aggtgacact cgctgatgct ggcttcatga
23941 agcaatatgg cgaatgccta ggtgatatta atgctagaga tctcatttgt gcgcagaagt
24001 tcaatggact tacagtgttg ccacctctgc tcactgatga tatgattgct gcctacactg
24061 ctgctctagt tagtggtact gccactgctg gatggacatt tggtgctggc gctgctcttc
24121 aaataccttt tgctatgcaa atggcatata ggttcaatgg cattggagtt acccaaaatg
24181 ttctctatga gaaccaaaaa caaatcgcca accaatttaa caaggcgatt agtcaaattc
24241 aagaatcact tacaacaaca tcaactgcat tgggcaagct gcaagacgtt gttaaccaga
24301 atgctcaagc attaaacaca cttgttaaac aacttagctc taattttggt gcaatttcaa
24361 gtgtgctaaa tgatatcctt tcgcgacttg ataaagtcga ggcggaggta caaattgaca
24421 ggttaattac aggcagactt caaagccttc aaacctatgt aacacaacaa ctaatcaggg
24481 ctgctgaaat cagggcttct gctaatcttg ctgctactaa aatgtctgag tgtgttcttg
24541 gacaatcaaa aagagttgac ttttgtggaa agggctacca ccttatgtcc ttcccacaag
24601 cagccccgca tggtgttgtc ttcctacatg tcacgtatgt gccatcccag gagaggaact
24661 tcaccacagc gccagcaatt tgtcatgaag gcaaagcata cttccctcgt gaaggtgttt
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24901 acttcaaaaa tcatacatca ccagatgttg atcttggcga catttcaggc attaacgctt
24961 ctgtcgtcaa cattcaaaaa gaaattgacc gcctcaatga ggtcgctaaa aatttaaatg
25021 aatcactcat tgaccttcaa gaattgggaa aatatgagca atatattaaa tggccttggt
25081 atgtttggct cggcttcatt gctggactaa ttgccatcgt catggttaca atcttgcttt
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25741 accatataac agtgtcacag atacaattgt cgttactgaa ggtgacggca tttcaacacc
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25861 agactatgtc gttgtacatg gctatttcac cgaagtttac taccagcttg agtctacaca
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26281 ggtttacgtc tactcgcgtg ttaaaaatct gaactcttct gaaggagttc ctgatcttct
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27721 ttggttttca ctcgaaatcc aggatctaga agaaccttgt accaaagtct aaacgaacat
27781 gaaacttctc attgttttga cttgtatttc tctatgcagt tgcatatgca ctgtagtaca
27841 gcgctgtgca tctaataaac ctcatgtgct tgaagatcct tgtaaggtac aacactaggg
27901 gtaatactta tagcactgct tggctttgtg ctctaggaaa ggttttacct tttcatagat
27961 ggcacactat ggttcaaaca tgcacaccta atgttactat caactgtcaa gatccagctg
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28681 tcatcacgta gtcgcggtaa ttcaagaaat tcaactcctg gcagcagtag gggaaattct
28741 cctgctcgaa tggctagcgg aggtggtgaa actgccctcg cgctattgct gctagacaga
28801 ttgaaccagc ttgagagcaa agtttctggt aaaggccaac aacaacaagg ccaaactgtc
28861 actaagaaat ctgctgctga ggcatctaaa aagcctcgcc aaaaacgtac tgccacaaaa
28921 cagtacaacg tcactcaagc atttgggaga cgtggtccag aacaaaccca aggaaatttc
28981 ggggaccaag acctaatcag acaaggaact gattacaaac attggccgca aattgcacaa
29041 tttgctccaa gtgcctctgc attctttgga atgtcacgca ttggcatgga agtcacacct
29101 tcgggaacat ggctgactta tcatggagcc attaaattgg atgacaaaga tccacaattc
29161 aaagacaacg tcatactgct gaacaagcac attgacgcat acaaaacatt cccaccaaca
29221 gagcctaaaa aggacaaaaa gaaaaagact gatgaagctc agcctttgcc gcagagacaa
29281 aagaagcagc ccactgtgac tcttcttcct gcggctgaca tggatgattt ctccagacaa
29341 cttcaaaatt ccatgagtgg agcttctgct gattcaactc aggcataaac actcatgatg
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29461 tactcttgtg cagaatgaat tctcgtaact aaacagcaca agtaggttta gttaacttta
29521 atctcacata gcaatcttta atcaatgtgt aacattaggg aggacttgaa agagccacca
29581 cattttcatc gaggccacgc ggagtacgat cgagggtaca gtgaataatg ctagggagag
29641 ctgcctatat ggaagagccc taatgtgtaa aattaatttt agtagtgcta tccccatgtg
29701 attttaatag cttcttagga gaatgac
SARS是一种新的急性传染性疾病，病原、传播以及成因都是未知数。自发现SARS以来，医务工作都就紧张的寻找病原。刚开始所有非典型肺炎的病原（军团菌、衣原体、微球菌以及病毒等）都曾被怀疑，军团菌、微球菌逐渐被排除。从香港、中国大陆以及加拿大等地实验室陆续从患者体内检测出人类间质肺病毒(metapneumovirus, paramyxoviridae副黏液病毒科)、衣原体以及冠状病毒（coronavirus）。对于SARS的病原一时众说纷纭。
最近，德国、加拿大、美国科学家使用更多方法检验了以上三种病原的可能性，最终确认一种新的冠状病毒与SARS密切相关，推测它是致病的元凶。最权威的临床学术刊物《新英格兰杂志》于十日刊登了最新研究成果，各国科学家拿出的结果惊人的相似，近似于100%的相同，在对新病毒测序中，全长30000个碱基只有100多不同，显示目前病毒以很稳定的存在环境中。
近日中国科学院院士洪涛也认同新的冠状病毒是致病元凶。但同时坚持SARS是多病原体引起的，衣原体也是其中重要的一种。
病毒发现历程：
首先各自收集亚洲地区为主的SARS检体样本进行已知的病源测试，在这一部份大多数的检体都呈现阴性，显示这是由新的病源所引起。
接着他们将病源进行的活体外培养，美国科学家使用了芯片技术与所有病毒进行杂交，发现与冠状病毒最近，而以后的测序也验证了这一点。这个结论与德、加等国的研究成果完全一致。
新病毒的特点：
冠状病毒的出现最令科学家惊讶，因为依据过去的了解冠状病毒对人造成危害的例子不多，唯一与呼吸道疾病有关的症状并不像SARS这么严重，而且基因序列也有极大的差异。国际SARS研究团队在发现新种冠状病毒之后，旋即以血清学分析、免疫组织染色、PCR等方法检查手中现有的检体，在18个检体中果真有一种以上的方法呈现阳性，证实新种冠状病毒与SARS的相关。另外德国科学家则是实时定量PCR的方法(real-time PCR)来侦测病毒的存在与数目，经过试验可以区分冠状病毒在SARS可能患者与健康对照的有无。
病毒来源：
依据新种冠状病毒与已知冠状病毒的演化树分布，SARS-冠状病毒应该是变种而来，如果能了解病毒的来源，或许就能更了解新种冠状病毒的传染机制与传播途径。另外，依据柯霍氏法则(Koch’s postulates)，在SARS患者上发现冠状病毒的存在仅能说明两者有关系，但未必就确定新种冠状病毒就是元凶，研究团队还需要更多的实验才能确认新种冠状病毒是SARS的病源。
荷兰Utrecht大学的Peter Rottier说。Rottier的研究小组通过向猫细胞导入传染性猫腹脑炎病毒（feline infectious peritonitis virus，FIPV）创造出这种新冠状病毒。FIPV是一种常见病原体，5％的猫都是死于该病毒。研究人员给FIPV导入小鼠冠状病毒的一个基因片段，该基因编码一种外壳蛋白可以识别并帮助穿透小鼠细胞。 几个小时后，猫FIPV病毒的一些病毒粒子的外壳蛋白基因变成了小鼠的外壳基因，因而可以感染小鼠细胞了。如果两种蛋白同时感染同一细胞就可能发生这种情况。 这个结果支持了SARS冠状病毒可能是在动物和人类病毒相遇，发生基因交换时产生的观点，也提示了病源来源于动物的可能。同时这项研究也证明了一个同怕的问题：冠状病毒通过基因改变能够轻易地改变感染宿主。
由于冠状病毒能够很容易的与动物或其它病毒发生基因转移性重组，因此理论上生物恐怖分子可以利用这一技术制造出危害性更大的新病源。但科技总是双刃剑，利用这一技术也可以制造出保护性疫苗。Rottier的研究小组已开始研制抗冠状病毒的活疫苗。他们筛选了感染小鼠的FIPV中由于基因交换变为无毒的病毒株。他们发现，用这些病毒株中的一种结种猫，可以防止猫感染上原始的致命FIPV。
最新检测方法：
病毒的基因序列已经确定，所以RT－PCR是检测病毒最快的也是最好的方法。德国汉堡的一家公司已经开发出该病毒的实时荧光定量检测试剂。
附，基因序列
1 atattaggtt tttacctacc caggaaaagc caaccaacct cgatctcttg tagatctgtt
61 ctctaaacga actttaaaat ctgtgtagct gtcgctcggc tgcatgccta gtgcacctac
121 gcagtataaa caataataaa ttttactgtc gttgacaaga aacgagtaac tcgtccctct
181 tctgcagact gcttacggtt tcgtccgtgt tgcagtcgat catcagcata cctaggtttc
241 gtccgggtgt gaccgaaagg taagatggag agccttgttc ttggtgtcaa cgagaaaaca
301 cacgtccaac tcagtttgcc tgtccttcag gttagagacg tgctagtgcg tggcttcggg
361 gactctgtgg aagaggccct atcggaggca cgtgaacacc tcaaaaatgg cacttgtggt
421 ctagtagagc tggaaaaagg cgtactgccc cagcttgaac agccctatgt gttcattaaa
481 cgttctgatg ccttaagcac caatcacggc cacaaggtcg ttgagctggt tgcagaaatg
541 gacggcattc agtacggtcg tagcggtata acactgggag tactcgtgcc acatgtgggc
601 gaaaccccaa ttgcataccg caatgttctt cttcgtaaga acggtaataa gggagccggt
661 ggtcatagct atggcatcga tctaaagtct tatgacttag gtgacgagct tggcactgat
721 cccattgaag attatgaaca aaactggaac actaagcatg gcagtggtgc actccgtgaa
781 ctcactcgtg agctcaatgg aggtgcagtc actcgctatg tcgacaacaa tttctgtggc
841 ccagatgggt accctcttga ttgcatcaaa gattttctcg cacgcgcggg caagtcaatg
901 tgcactcttt ccgaacaact tgattacatc gagtcgaaga gaggtgtcta ctgctgccgt
961 gaccatgagc atgaaattgc ctggttcact gagcgctctg ataagagcta cgagcaccag
1021 acacccttcg aaattaagag tgccaagaaa tttgacactt tcaaagggga atgcccaaag
1081 tttgtgtttc ctcttaactc aaaagtcaaa gtcattcaac cacgtgttga aaagaaaaag
1141 actgagggtt tcatggggcg tatacgctct gtgtaccctg ttgcatctcc acaggagtgt
1201 aacaatatgc acttgtctac cttgatgaaa tgtaatcatt gcgatgaagt ttcatggcag
1261 acgtgcgact ttctgaaagc cacttgtgaa cattgtggca ctgaaaattt agttattgaa
1321 ggacctacta catgtgggta cctacctact aatgctgtag tgaaaatgcc atgtcctgcc
1381 tgtcaagacc cagagattgg acctgagcat agtgttgcag attatcacaa ccactcaaac
1441 attgaaactc gactccgcaa gggaggtagg actagatgtt ttggaggctg tgtgtttgcc
1501 tatgttggct gctataataa gcgtgcctac tgggttcctc gtgctagtgc tgatattggc
1561 tcaggccata ctggcattac tggtgacaat gtggagacct tgaatgagga tctccttgag
1621 atactgagtc gtgaacgtgt taacattaac attgttggcg attttcattt gaatgaagag
1681 gttgccatca ttttggcatc tttctctgct tctacaagtg cctttattga cactataaag
1741 agtcttgatt acaagtcttt caaaaccatt gttgagtcct gcggtaacta taaagttacc
1801 aagggaaagc ccgtaaaagg tgcttggaac attggacaac agagatcagt tttaacacca
1861 ctgtgtggtt ttccctcaca ggctgctggt gttatcagat caatttttgc gcgcacactt
1921 gatgcagcaa accactcaat tcctgatttg caaagagcag ctgtcaccat acttgatggt
1981 atttctgaac agtcattacg tcttgtcgac gccatggttt atacttcaga cctgctcacc
2041 aacagtgtca ttattatggc atatgtaact ggtggtcttg tacaacagac ttctcagtgg
2101 ttgtctaatc ttttgggcac tactgttgaa aaactcaggc ctatctttga atggattgag
2161 gcgaaactta gtgcaggagt tgaatttctc aaggatgctt gggagattct caaatttctc
2221 attacaggtg tttttgacat cgtcaagggt caaatacagg ttgcttcaga taacatcaag
2281 gattgtgtaa aatgcttcat tgatgttgtt aacaaggcac tcgaaatgtg cattgatcaa
2341 gtcactatcg ctggcgcaaa gttgcgatca ctcaacttag gtgaagtctt catcgctcaa
2401 agcaagggac tttaccgtca gtgtatacgt ggcaaggagc agctgcaact actcatgcct
2461 cttaaggcac caaaagaagt aacctttctt gaaggtgatt cacatgacac agtacttacc
2521 tctgaggagg ttgttctcaa gaacggtgaa ctcgaagcac tcgagacgcc cgttgatagc
2581 ttcacaaatg gagctatcgt tggcacacca gtctgtgtaa atggcctcat gctcttagag
2641 attaaggaca aagaacaata ctgcgcattg tctcctggtt tactggctac aaacaatgtc
2701 tttcgcttaa aagggggtgc accaattaaa ggtgtaacct ttggagaaga tactgtttgg
2761 gaagttcaag gttacaagaa tgtgagaatc acatttgagc ttgatgaacg tgttgacaaa
2821 gtgcttaatg aaaagtgctc tgtctacact gttgaatccg gtaccgaagt tactgagttt
2881 gcatgtgttg tagcagaggc tgttgtgaag actttacaac cagtttctga tctccttacc
2941 aacatgggta ttgatcttga tgagtggagt gtagctacat tctacttatt tgatgatgct
3001 ggtgaagaaa acttttcatc acgtatgtat tgttcctttt accctccaga tgaggaagaa
3061 gaggacgatg cagagtgtga ggaagaagaa attgatgaaa cctgtgaaca tgagtacggt
3121 acagaggatg attatcaagg tctccctctg gaatttggtg cctcagctga aacagttcga
3181 gttgaggaag aagaagagga agactggctg gatgatacta ctgagcaatc agagattgag
3241 ccagaaccag aacctacacc tgaagaacca gttaatcagt ttactggtta tttaaaactt
3301 actgacaatg ttgccattaa atgtgttgac atcgttaagg aggcacaaag tgctaatcct
3361 atggtgattg taaatgctgc taacatacac ctgaaacatg gtggtggtgt agcaggtgca
3421 ctcaacaagg caaccaatgg tgccatgcaa aaggagagtg atgattacat taagctaaat
3481 ggccctctta cagtaggagg gtcttgtttg ctttctggac ataatcttgc taagaagtgt
3541 ctgcatgttg ttggacctaa cctaaatgca ggtgaggaca tccagcttct taaggcagca
3601 tatgaaaatt tcaattcaca ggacatctta cttgcaccat tgttgtcagc aggcatattt
3661 ggtgctaaac cacttcagtc tttacaagtg tgcgtgcaga cggttcgtac acaggtttat
3721 attgcagtca atgacaaagc tctttatgag caggttgtca tggattatct tgataacctg
3781 aagcctagag tggaagcacc taaacaagag gagccaccaa acacagaaga ttccaaaact
3841 gaggagaaat ctgtcgtaca gaagcctgtc gatgtgaagc caaaaattaa ggcctgcatt
3901 gatgaggtta ccacaacact ggaagaaact aagtttctta ccaataagtt actcttgttt
3961 gctgatatca atggtaagct ttaccatgat tctcagaaca tgcttagagg tgaagatatg
4021 tctttccttg agaaggatgc accttacatg gtaggtgatg ttatcactag tggtgatatc
4081 acttgtgttg taataccctc caaaaaggct ggtggcacta ctgagatgct ctcaagagct
4141 ttgaagaaag tgccagttga tgagtatata accacgtacc ctggacaagg atgtgctggt
4201 tatacacttg aggaagctaa gactgctctt aagaaatgca aatctgcatt ttatgtacta
4261 ccttcagaag cacctaatgc taaggaagag attctaggaa ctgtatcctg gaatttgaga
4321 gaaatgcttg ctcatgctga agagacaaga aaattaatgc ctatatgcat ggatgttaga
4381 gccataatgg caaccatcca acgtaagtat aaaggaatta aaattcaaga gggcatcgtt
4441 gactatggtg tccgattctt cttttatact agtaaagagc ctgtagcttc tattattacg
4501 aagctgaact ctctaaatga gccgcttgtc acaatgccaa ttggttatgt gacacatggt
4561 tttaatcttg aagaggctgc gcgctgtatg cgttctctta aagctcctgc cgtagtgtca
4621 gtatcatcac cagatgctgt tactacatat aatggatacc tcacttcgtc atcaaagaca
4681 tctgaggagc actttgtaga aacagtttct ttggctggct cttacagaga ttggtcctat
4741 tcaggacagc gtacagagtt aggtgttgaa tttcttaagc gtggtgacaa aattgtgtac
4801 cacactctgg agagccccgt cgagtttcat cttgacggtg aggttctttc acttgacaaa
4861 ctaaagagtc tcttatccct gcgggaggtt aagactataa aagtgttcac aactgtggac
4921 aacactaatc tccacacaca gcttgtggat atgtctatga catatggaca gcagtttggt
4981 ccaacatact tggatggtgc tgatgttaca aaaattaaac ctcatgtaaa tcatgagggt
5041 aagactttct ttgtactacc tagtgatgac acactacgta gtgaagcttt cgagtactac
5101 catactcttg atgagagttt tcttggtagg tacatgtctg ctttaaacca cacaaagaaa
5161 tggaaatttc ctcaagttgg tggtttaact tcaattaaat gggctgataa caattgttat
5221 ttgtctagtg ttttattagc acttcaacag cttgaagtca aattcaatgc accagcactt
5281 caagaggctt attatagagc ccgtgctggt gatgctgcta acttttgtgc actcatactc
5341 gcttacagta ataaaactgt tggcgagctt ggtgatgtca gagaaactat gacccatctt
5401 ctacagcatg ctaatttgga atctgcaaag cgagttctta atgtggtgtg taaacattgt
5461 ggtcagaaaa ctactacctt aacgggtgta gaagctgtga tgtatatggg tactctatct
5521 tatgataatc ttaagacagg tgtttccatt ccatgtgtgt gtggtcgtga tgctacacaa
5581 tatctagtac aacaagagtc ttcttttgtt atgatgtctg caccacctgc tgagtataaa
5641 ttacagcaag gtacattctt atgtgcgaat gagtacactg gtaactatca gtgtggtcat
5701 tacactcata taactgctaa ggagaccctc tatcgtattg acggagctca ccttacaaag
5761 atgtcagagt acaaaggacc agtgactgat gttttctaca aggaaacatc ttacactaca
5821 accatcaagc ctgtgtcgta taaactcgat ggagttactt acacagagat tgaaccaaaa
5881 ttggatgggt attataaaaa ggataatgct tactatacag agcagcctat agaccttgta
5941 ccaactcaac cattaccaaa tgcgagtttt gataatttca aactcacatg ttctaacaca
6001 aaatttgctg atgatttaaa tcaaatgaca ggcttcacaa agccagcttc acgagagcta
6061 tctgtcacat tcttcccaga cttgaatggc gatgtagtgg ctattgacta tagacactat
6121 tcagcgagtt tcaagaaagg tgctaaatta ctgcataagc caattgtttg gcacattaac
6181 caggctacaa ccaagacaac gttcaaacca aacacttggt gtttacgttg tctttggagt
6241 acaaagccag tagatacttc aaattcattt gaagttctgg cagtagaaga cacacaagga
6301 atggacaatc ttgcttgtga aagtcaacaa cccacctctg aagaagtagt ggaaaatcct
6361 accatacaga aggaagtcat agagtgtgac gtgaaaacta ccgaagttgt aggcaatgtc
6421 atacttaaac catcagatga aggtgttaaa gtaacacaag agttaggtca tgaggatctt
6481 atggctgctt atgtggaaaa cacaagcatt accattaaga aacctaatga gctttcacta
6541 gccttaggtt taaaaacaat tgccactcat ggtattgctg caattaatag tgttccttgg
6601 agtaaaattt tggcttatgt caaaccattc ttaggacaag cagcaattac aacatcaaat
6661 tgcgctaaga gattagcaca acgtgtgttt aacaattata tgccttatgt gtttacatta
6721 ttgttccaat tgtgtacttt tactaaaagt accaattcta gaattagagc ttcactacct
6781 acaactattg ctaaaaatag tgttaagagt gttgctaaat tatgtttgga tgccggcatt
6841 aattatgtga agtcacccaa attttctaaa ttgttcacaa tcgctatgtg gctattgttg
6901 ttaagtattt gcttaggttc tctaatctgt gtaactgctg cttttggtgt actcttatct
6961 aattttggtg ctccttctta ttgtaatggc gttagagaat tgtatcttaa ttcgtctaac
7021 gttactacta tggatttctg tgaaggttct tttccttgca gcatttgttt aagtggatta
7081 gactcccttg attcttatcc agctcttgaa accattcagg tgacgatttc atcgtacaag
7141 ctagacttga caattttagg tctggccgct gagtgggttt tggcatatat gttgttcaca
7201 aaattctttt atttattagg tctttcagct ataatgcagg tgttctttgg ctattttgct
7261 agtcatttca tcagcaattc ttggctcatg tggtttatca ttagtattgt acaaatggca
7321 cccgtttctg caatggttag gatgtacatc ttctttgctt ctttctacta catatggaag
7381 agctatgttc atatcatgga tggttgcacc tcttcgactt gcatgatgtg ctataagcgc
7441 aatcgtgcca cacgcgttga gtgtacaact attgttaatg gcatgaagag atctttctat
7501 gtctatgcaa atggaggccg tggcttctgc aagactcaca attggaattg tctcaattgt
7561 gacacatttt gcactggtag tacattcatt agtgatgaag ttgctcgtga tttgtcactc
7621 cagtttaaaa gaccaatcaa ccctactgac cagtcatcgt atattgttga tagtgttgct
7681 gtgaaaaatg gcgcgcttca cctctacttt gacaaggctg gtcaaaagac ctatgagaga
7741 catccgctct cccattttgt caatttagac aatttgagag ctaacaacac taaaggttca
7801 ctgcctatta atgtcatagt ttttgatggc aagtccaaat gcgacgagtc tgcttctaag
7861 tctgcttctg tgtactacag tcagctgatg tgccaaccta ttctgttgct tgaccaagtt
7921 cttgtatcag acgttggaga tagtactgaa gtttccgtta agatgtttga tgcttatgtc
7981 gacacctttt cagcaacttt tagtgttcct atggaaaaac ttaaggcact tgttgctaca
8041 gctcacagcg agttagcaaa gggtgtagct ttagatggtg tcctttctac attcgtgtca
8101 gctgcccgac aaggtgttgt tgataccgat gttgacacaa aggatgttat tgaatgtctc
8161 aaactttcac atcactctga cttagaagtg acaggtgaca gttgtaacaa tttcatgctc
8221 acctataata aggttgaaaa catgacgccc agagatcttg gcgcatgtat tgactgtaat
8281 gcaaggcata tcaatgccca agtagcaaaa agtcacaatg tttcactcat ctggaatgta
8341 aaagactaca tgtctttatc tgaacagctg cgtaaacaaa ttcgtagtgc tgccaagaag
8401 aacaacatac cttttagact aacttgtgct acaactagac aggttgtcaa tgtcataact
8461 actaaaatct cactcaaggg tggtaagatt gttagtactt gttttaaact tatgcttaag
8521 gccacattat tgtgcgttct tgctgcattg gtttgttata tcgttatgcc agtacataca
8581 ttgtcaatcc atgatggtta cacaaatgaa atcattggtt acaaagccat tcaggatggt
8641 gtcactcgtg acatcatttc tactgatgat tgttttgcaa ataaacatgc tggttttgac
8701 gcatggttta gccagcgtgg tggttcatac aaaaatgaca aaagctgccc tgtagtagct
8761 gctatcatta caagagagat tggtttcata gtgcctggct taccgggtac tgtgctgaga
8821 gcaatcaatg gtgacttctt gcattttcta cctcgtgttt ttagtgctgt tggcaacatt
8881 tgctacacac cttccaaact cattgagtat agtgattttg ctacctctgc ttgcgttctt
8941 gctgctgagt gtacaatttt taaggatgct atgggcaaac ctgtgccata ttgttatgac
9001 actaatttgc tagagggttc tatttcttat agtgagcttc gtccagacac tcgttatgtg
9061 cttatggatg gttccatcat acagtttcct aacacttacc tggagggttc tgttagagta
9121 gtaacaactt ttgatgctga gtactgtaga catggtacat gcgaaaggtc agaagtaggt
9181 atttgcctat ctaccagtgg tagatgggtt cttaataatg agcattacag agctctatca
9241 ggagttttct gtggtgttga tgcgatgaat ctcatagcta acatctttac tcctcttgtg
9301 caacctgtgg gtgctttaga tgtgtctgct tcagtagtgg ctggtggtat tattgccata
9361 ttggtgactt gtgctgccta ctactttatg aaattcagac gtgtttttgg tgagtacaac
9421 catgttgttg ctgctaatgc acttttgttt ttgatgtctt tcactatact ctgtctggta
9481 ccagcttaca gctttctgcc gggagtctac tcagtctttt acttgtactt gacattctat
9541 ttcaccaatg atgtttcatt cttggctcac cttcaatggt ttgccatgtt ttctcctatt
9601 gtgccttttt ggataacagc aatctatgta ttctgtattt ctctgaagca ctgccattgg
9661 ttctttaaca actatcttag gaaaagagtc atgtttaatg gagttacatt tagtaccttc
9721 gaggaggctg ctttgtgtac ctttttgctc aacaaggaaa tgtacctaaa attgcgtagc
9781 gagacactgt tgccacttac acagtataac aggtatcttg ctctatataa caagtacaag
9841 tatttcagtg gagccttaga tactaccagc tatcgtgaag cagcttgctg ccacttagca
9901 aaggctctaa atgactttag caactcaggt gctgatgttc tctaccaacc accacagaca
9961 tcaatcactt ctgctgttct gcagagtggt tttaggaaaa tggcattccc gtcaggcaaa
10021 gttgaagggt gcatggtaca agtaacctgt ggaactacaa ctcttaatgg attgtggttg
10081 gatgacacag tatactgtcc aagacatgtc atttgcacag cagaagacat gcttaatcct
10141 aactatgaag atctgctcat tcgcaaatcc aaccatagct ttcttgttca ggctggcaat
10201 gttcaacttc gtgttattgg ccattctatg caaaattgtc tgcttaggct taaagttgat
10261 acttctaacc ctaagacacc caagtataaa tttgtccgta tccaacctgg tcaaacattt
10321 tcagttctag catgctacaa tggttcacca tctggtgttt atcagtgtgc catgagacct
10381 aatcatacca ttaaaggttc tttccttaat ggatcatgtg gtagtgttgg ttttaacatt
10441 gattatgatt gcgtgtcttt ctgctatatg catcatatgg agcttccaac aggagtacac
10501 gctggtactg acttagaagg taaattctat ggtccatttg ttgacagaca aactgcacag
10561 gctgcaggta cagacacaac cataacatta aatgttttgg catggctgta tgctgctgtt
10621 atcaatggtg ataggtggtt tcttaataga ttcaccacta ctttgaatga ctttaacctt
10681 gtggcaatga agtacaacta tgaacctttg acacaagatc atgttgacat attgggacct
10741 ctttctgctc aaacaggaat tgccgtctta gatatgtgtg ctgctttgaa agagctgctg
10801 cagaatggta tgaatggtcg tactatcctt ggtagcacta ttttagaaga tgagtttaca
10861 ccatttgatg ttgttagaca atgctctggt gttaccttcc aaggtaagtt caagaaaatt
10921 gttaagggca ctcatcattg gatgctttta actttcttga catcactatt gattcttgtt
10981 caaagtacac agtggtcact gtttttcttt gtttacgaga atgctttctt gccatttact
11041 cttggtatta tggcaattgc tgcatgtgct atgctgcttg ttaagcataa gcacgcattc
11101 ttgtgcttgt ttctgttacc ttctcttgca acagttgctt actttaatat ggtctacatg
11161 cctgctagct gggtgatgcg tatcatgaca tggcttgaat tggctgacac tagcttgtct
11221 ggttataggc ttaaggattg tgttatgtat gcttcagctt tagttttgct tattctcatg
11281 acagctcgca ctgtttatga tgatgctgct agacgtgttt ggacactgat gaatgtcatt
11341 acacttgttt acaaagtcta ctatggtaat gctttagatc aagctatttc catgtgggcc
11401 ttagttattt ctgtaacctc taactattct ggtgtcgtta cgactatcat gtttttagct
11461 agagctatag tgtttgtgtg tgttgagtat tacccattgt tatttattac tggcaacacc
11521 ttacagtgta tcatgcttgt ttattgtttc ttaggctatt gttgctgctg ctactttggc
11581 cttttctgtt tactcaaccg ttacttcagg cttactcttg gtgtttatga ctacttggtc
11641 tctacacaag aatttaggta tatgaactcc caggggcttt tgcctcctaa gagtagtatt
11701 gatgctttca agcttaacat taagttgttg ggtattggag gtaaaccatg tatcaaggtt
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11821 cttcaacaac ttagagtaga gtcatcttct aaattgtggg cacaatgtgt acaactccac
11881 aatgatattc ttcttgcaaa agacacaact gaagctttcg agaagatggt ttctcttttg
11941 tctgttttgc tatccatgca gggtgctgta gacattaata ggttgtgcga ggaaatgctc
12001 gataaccgtg ctactcttca ggctattgct tcagaattta gttctttacc atcatatgcc
12061 gcttatgcca ctgcccagga ggcctatgag caggctgtag ctaatggtga ttctgaagtc
12121 gttctcaaaa agttaaagaa atctttgaat gtggctaaat ctgagtttga ccgtgatgct
12181 gccatgcaac gcaagttgga aaagatggca gatcaggcta tgacccaaat gtacaaacag
12241 gcaagatctg aggacaagag ggcaaaagta actagtgcta tgcaaacaat gctcttcact
12301 atgcttagga agcttgataa tgatgcactt aacaacatta tcaacaatgc gcgtgatggt
12361 tgtgttccac tcaacatcat accattgact acagcagcca aactcatggt tgttgtccct
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12541 atggacaatt caccaaattt ggcttggcct cttattgtta cagctctaag agccaactca
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12721 aagggaggta ggtttgtgct ggcattacta tcagaccacc aagatctcaa atgggctaga
12781 ttccctaaga gtgatggtac aggtacaatt tacacagaac tggaaccacc ttgtaggttt
12841 gttacagaca caccaaaagg gcctaaagtg aaatacttgt acttcatcaa aggcttaaac
12901 aacctaaata gaggtatggt gctgggcagt ttagctgcta cagtacgtct tcaggctgga
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13021 cctgctaaag catataagga ttacctagca agtggaggac aaccaatcac caactgtgtg
13081 aagatgttgt gtacacacac tggtacagga caggcaatta ctgtaacacc agaagctaac
13141 atggaccaag agtcctttgg tggtgcttca tgttgtctgt attgtagatg ccacattgac
13201 catccaaatc ctaaaggatt ctgtgacttg aaaggtaagt acgtccaaat acctaccact
13261 tgtgctaatg acccagtggg ttttacactt agaaacacag tctgtaccgt ctgcggaatg
13321 tggaaaggtt atggctgtag ttgtgaccaa ctccgcgaac ccttgatgca gtctgcggat
13381 gcatcaacgt ttttaaacgg gtttgcggtg taagtgcagc ccgtcttaca ccgtgcggca
13441 caggcactag tactgatgtc gtctacaggg cttttgatat ttacaacgaa aaagttgctg
13501 gttttgcaaa gttcctaaaa actaattgct gtcgcttcca ggagaaggat gaggaaggca
13561 atttattaga ctcttacttt gtagttaaga ggcatactat gtctaactac caacatgaag
13621 agactattta taacttggtt aaagattgtc cagcggttgc tgtccatgac tttttcaagt
13681 ttagagtaga tggtgacatg gtaccacata tatcacgtca gcgtctaact aaatacacaa
13741 tggctgattt agtctatgct ctacgtcatt ttgatgaggg taattgtgat acattaaaag
13801 aaatactcgt cacatacaat tgctgtgatg atgattattt caataagaag gattggtatg
13861 acttcgtaga gaatcctgac atcttacgcg tatatgctaa cttaggtgag cgtgtacgcc
13921 aatcattatt aaagactgta caattctgcg atgctatgcg tgatgcaggc attgtaggcg
13981 tactgacatt agataatcag gatcttaatg ggaactggta cgatttcggt gatttcgtac
14041 aagtagcacc aggctgcgga gttcctattg tggattcata ttactcattg ctgatgccca
14101 tcctcacttt gactagggca ttggctgctg agtcccatat ggatgctgat ctcgcaaaac
14161 cacttattaa gtgggatttg ctgaaatatg attttacgga agagagactt tgtctcttcg
14221 accgttattt taaatattgg gaccagacat accatcccaa ttgtattaac tgtttggatg
14281 ataggtgtat ccttcattgt gcaaacttta atgtgttatt ttctactgtg tttccaccta
14341 caagttttgg accactagta agaaaaatat ttgtagatgg tgttcctttt gttgtttcaa
14401 ctggatacca ttttcgtgag ttaggagtcg tacataatca ggatgtaaac ttacatagct
14461 cgcgtctcag tttcaaggaa cttttagtgt atgctgctga tccagctatg catgcagctt
14521 ctggcaattt attgctagat aaacgcacta catgcttttc agtagctgca ctaacaaaca
14581 atgttgcttt tcaaactgtc aaacccggta attttaataa agacttttat gactttgctg
14641 tgtctaaagg tttctttaag gaaggaagtt ctgttgaact aaaacacttc ttctttgctc
14701 aggatggcaa cgctgctatc agtgattatg actattatcg ttataatctg ccaacaatgt
14761 gtgatatcag acaactccta ttcgtagttg aagttgttga taaatacttt gattgttacg
14821 atggtggctg tattaatgcc aaccaagtaa tcgttaacaa tctggataaa tcagctggtt
14881 tcccatttaa taaatggggt aaggctagac tttattatga ctcaatgagt tatgaggatc
14941 aagatgcact tttcgcgtat actaagcgta atgtcatccc tactataact caaatgaatc
15001 ttaagtatgc cattagtgca aagaatagag ctcgcaccgt agctggtgtc tctatctgta
15061 gtactatgac aaatagacag tttcatcaga aattattgaa gtcaatagcc gccactagag
15121 gagctactgt ggtaattgga acaagcaagt tttacggtgg ctggcataat atgttaaaaa
15181 ctgtttacag tgatgtagaa actccacacc ttatgggttg ggattatcca aaatgtgaca
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15301 cttgctgtaa cttatcacac cgtttctaca ggttagctaa cgagtgtgcg caagtattaa
15361 gtgagatggt catgtgtggc ggctcactat atgttaaacc aggtggaaca tcatccggtg
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15721 cagttcttta ttatcaaaat aatgtgttca tgtctgaggc aaaatgttgg actgagactg
15781 accttactaa aggacctcac gaattttgct cacagcatac aatgctagtt aaacaaggag
15841 atgattacgt gtacctgcct tacccagatc catcaagaat attaggcgca ggctgttttg
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15961 ttgatgctta cccacttaca aaacatccta atcaggagta tgctgatgtc tttcacttgt
16021 atttacaata cattagaaag ttacatgatg agcttactgg ccacatgttg gacatgtatt
16081 ccgtaatgct aactaatgat aacacctcac ggtactggga acctgagttt tatgaggcta
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16261 accatgtcat ttcaacatca cacaaattag tgttgtctgt taatccctat gtttgcaatg
16321 ccccaggttg tgatgtcact gatgtgacac aactgtatct aggaggtatg agctattatt
16381 gcaagtcaca taagcctccc attagttttc cattatgtgc taatggtcag gtttttggtt
16441 tatacaaaaa cacatgtgta ggcagtgaca atgtcactga cttcaatgcg atagcaacat
16501 gtgattggac taatgctggc gattacatac ttgccaacac ttgtactgag agactcaagc
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16741 aagtacagat tggagagtac acctttgaaa aaggtgacta tggtgatgct gttgtgtaca
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17161 gaatcatacc tgcgcgtgcg cgcgtagagt gttttgataa attcaaagtg aattcaacac
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17281 tctttgatga aatctctatg gctactaatt atgacttgag tgttgtcaat gctagacttc
17341 gtgcaaaaca ctacgtctat attggcgatc ctgctcaatt accagccccc cgcacattgc
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18061 taaagttcaa gactgaagga ttatgtgttg acataccagg cataccaaag gacatgacct
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19021 acgatgctca gccatgtagt gacaaagctt acaaaataga ggagctcttc tattcttatg
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,;ttgtccgtgg ttgggttttt ggttctacca tgaacaacaa gtcacagtcg gtgattatta
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