谷海瀛发现新细菌的经过
“这株细菌有点怪”
日前,海南省人民医院检验科主任谷海瀛收到了国际基因库发回的确认,承认其发现的新菌种并在国际基因库成功进行了注册,接受号为 AY120881。
另外,国家权威机构中国科学院微生物研究所也已经于今年6月7日对该株菌种作出结论。结论书上写着菌株 GU5828属于假单胞菌属,且与铜绿假单胞菌的亲缘关系最为接近,但是其 16SrRNA序列与铜绿假单胞菌相差较远,可考虑建立新种分类单位。
这是我国首次为国际基因库提交假单胞新菌种的16SrRNA全基因序列,同时该新菌种也是我国医学界首次发现的致病假单胞菌新菌种,该病菌能引发肺炎等一系列感染性疾病。
致此,这株新菌种从发现到最后被确认,经历了大半年的时间,终于完满地告上一段落。
这株细菌有点怪
这一发现要从去年10月份说起。
2001年10月25日,有一名62岁的男性肺炎患者在省人民医院住院。在对他进行的例行微生物检测报告单中这样写着:经对该患者的痰进行化验,为门多萨假单胞菌引起感染,但在“门多萨假单胞菌”旁又被人标明为“待进行鉴定”的字样。这是初次通过仪器鉴定的结果。
谷海瀛告诉记者,“待进行鉴定”是他标上去的,因为当时他就已经对这株细菌产生了怀疑。“这株细菌有点怪!”在观察的时候,他总觉得这株细菌的菌落形态与他脑子中所知道的门多萨假单胞菌不一致,且与他所知的菌种也不一样,但一下子他又说不出来是什么菌种。于是,虽然报告是照旧发布上去了,但问号却在他脑子里留了下来。
问号既然已经留了下来,谷海瀛是个藏不住的人。第二天,他就立即投入对这株“有点怪”的菌株进行继续观察和实验工作。
做的实验“没法数”
首先做的是细菌的动力测定,目的是通过测试该细菌的运动情况,与门多萨假单位胞菌进行比较,找出其异同之处。果然,他心里的猜测进一步得到证实,它们的运动情况根本就不相同。
接着,11月5日他又做了鞭毛染色、荚膜染色等实验,有了一个很突然的发现:该菌株没有侧鞭毛,而门多萨假单胞菌却是有侧鞭毛的。这时,他心里大概有了谱:这棵菌株绝对不是门多萨假单胞菌,但它到底是什么菌呢?还是由门多萨假单胞菌基因突变而来?又或者是一种从未被发现过的新菌种?
这么多的问号勾起了谷海瀛极大的兴趣,他大脑中的每个细胞似乎都为此而兴奋起来,...
这么多的问号勾起了谷海瀛极大的兴趣,他大脑中的每个细胞似乎都为此而兴奋起来,急切地想得知这株怪菌的真相。他本来就是个对微生物有着堪称“狂热”的研究者,工作的间隙、中午的休息时间、周六、周日,都是谷海瀛进行实验的好时间。
为了进一步弄清楚这到底是什么菌种,他又做了大量的实验———温度生长实验、氧化葡萄糖实验等鉴定其生物学特征的实验,以及测试该菌种对什么药物敏感的药敏实验等等。
每一项实验对谷海瀛来说,都是轻车熟路。但问题在于这些实验却极为繁琐,根据《国际伯杰细菌鉴定手册》和《美国临床微生物学手册》里要求的鉴定细菌的方法,一项项地做,有些实验还需要重复进行,需要大量的耐心和细心。
这些实验从去年11月3日一直做到今年3月下旬,才基本完成,总共做了多少次实验,他笑称“没法数了”。
除了做实验,他还需要查阅大量的资料文献,上网搜索专业网站上的专业资讯,将实验结果与既有资料对比、查证。去年11月27日,他的实验有了初步结论之后,他就将其送到军事医学科学院微生物研究所进行检验,当时的检验结论是认为可能是假单胞菌属中的一个新种,建议其作进一步的常规生物学鉴定。今年2月7日,他就将该菌株送到保藏管理委员会普通微生物中心保藏。
“科学是很严肃的事情,如果不是这样一项项地来鉴定它的各种特质,我也不敢轻易就说它是株新菌种。”谷海瀛像是天生研究微生物的,他的细心和耐心使得这项研究工作尽管缓慢却严谨地朝前进行着。在没有得到权威机构认可之前,他仍必须将所有的程序完成。
小鼠都死了
4月16日,谷海瀛开始做动物实验,目的是测试这种病菌的致病力如何。
当时是下午3点,他对21只小鼠进行了腹腔接种。当天还好,没什么事情发生。到了第二天,他发现小鼠开始死亡。在18小时之内,总共有19只小鼠陆续死亡。不久剩下的2只也死亡。将全部小鼠解剖后发现,小鼠的心、肺、肝、肠等内脏器官都受了细菌感染水肿而死。
“这种病菌具有较强致病力,我早就预料到了。”他介绍说,“因为在实验时就已经发现这种病菌有荚膜。有荚膜就意味着这种病菌的活动能力、感染能力很强。”
他告诉记者,目前他所能知的只是,这种病菌对小鼠而言,能引起各种感染发生,因为小鼠的各器官都受到感染了。但对人类如何,目前所知的仅有一例由该菌种引起的病例,就是去年10月份入院的病人,当时他患的病是双下肺炎,病情相当严重。但是不是还会引发其它感染,会达到一种什么程度,目前尚不得而知,只知道这种菌种绝非“善类”,可能同样会引发各种感染。
经过药敏实验,发现庆大霉素、亚胺培南等药物对该菌种治疗效果较好,但先锋1、呋喃妥因等药物则没什么效果。
得到国际权威机构的确认,谷海瀛的研究算是告了一段落。但是对于一株新发现的菌种,研究的路还没有走完。“这种菌的感染情况到底如何?除了肺炎,是否还会引起其它感染?什么药物对它才是最好的治疗?”谷海瀛说道,“研究的路还很长。目前只知它的致病力较强,但到底强到什么程度?许许多多的问号,都需要一一去解答。但这种研究需要有病例的配合,一旦有此种病例发生,就能更好地对其进行研究。”
细心一些就能发现
根据国际细菌命名法规,发现者具有命名权的规定,省人民医院检验科主任谷海瀛告诉记者,他决定将新发现的菌株命名为“海南假单胞”,因为这是在海南发现的新菌种。
“这也是对海南医学界、科技界的重大贡献,而将此菌种取名为海南假单胞,更是对海南做出一大贡献。”省人民医院院长郑万川这样评价道,“该病菌的发现有助于对由该菌引起的感染进行治疗,对临床治疗提供一个合理的用药依据,同时也为各国科学家研究各种菌类的进化提供参考。”
发现新菌种对有些人来说,是可遇而不可求或梦寐一生都无法实现的幸事,可对谷海瀛来说,这竟然已经是他第三次发现新菌种了。上天似乎特别厚爱这个年青有为的检验医师。谷海瀛似乎天生就是研究微生物的料,他的细心、耐心和独具的立体思维能力,都决定了他的成功。
1993年,当时还在沈阳铁路局吉林中心医院当检验师的谷海瀛,从败血症患者的血中分离发现一株新菌,经中国科学院微生物研究所鉴定并检索国际基因库确认为新菌,并命名为“谷氏菌”,这是中国人发现的第一株新科细菌,从而改变了以往华人未曾发现新致病菌的历史,载入世界细菌学史册。而这时,他年仅27岁,是一个刚从学校毕业没几年的普通检验师。
