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荧光产物增强逆转录酶活性检测方法的建立及应用

医学检验信息网 检验医学 2007-1-31 12:16:25

目前发现,逆转录酶是所有逆转录病毒中的一个重要标志,凡是逆转录病毒中均携带逆转录酶,逆转录酶活性的高低可即时反映逆转录病毒的感染程度,而不受病毒基因序列的影响。在过去几年中,国内外文献多次报道了逆转录病毒及逆转录酶的检测方法,我们以MS2 RNA为模板,采用荧光产物增强逆转录酶活性分析(single-tube fluorescent product-enhanced reverse transcriptase assay , STF-PERT),用于临床标本和献血员中逆转录病毒的检测。此方法对及时发现逆转录病毒感染,提高生物制品、血液制品、活性疫苗等制品的安全性有着十分重要的意义。

1 材料和方法 1.1 材料 由西安市中心血站随机抽检的500份献血员血液样本;引物及探针的设计:Primer A: 5’-GCC TTA GCA GTG CCC TGT CT-3’ ,Primer B: 5’-AAC ATG CTC GAG GGC CTT A-3’,Probe: 5’-FAM-CCC GTG GGA TGC TCC TAC ATG TCA-TAMRA-3’,由美国华盛顿病毒研究所唐方信博士提供,上海生化生工工程公司合成; MS2 RNA模板,购自罗氏诊断试剂公司。M-MLV逆转录酶,购自华美生物公司。以上试剂和标本均用DEPC处理水制备。 1.2 方法 1.2.1 标本处理及病毒裂解 在500ul血清中加入250ul含30% PEG 的0.4mol/L NaCl,4℃ 2 h。离心2800 r/min,30m in。弃上清,加入50ul 病毒裂解液(含0.8 mol/L NaCl,0.5% Triton X-100, 0.5mmol/L苯甲基磺酰氟,20%甘油,50mmol/L pH7.9 的Tris,1mmol/L DTT),37℃ 30min,12000r/min,离心15min,取上清备用。 1.2.2 逆转录反应 反应总体积为25ul, 包括10×PERT RT Buffer 2.5 ul,2.5 mM dNTPs 2 ul,25 pmol/ul primer A 1.3 ul,40 U/ul RNasin 0.2 ul,100 mM DTT 0.5 ul,MS2 RNA 300ng/ul 1ul,样品处理上清 10 ul,H2O 7.5 ul。反应条件为37°C 90 min,95°C 10 min。 1.2.3 PCR反应及荧光信号检测 将以下PCR反应液(10×PCR Buffer 5 ul,2.5 mM dNTPs 4 ul,25 pmol primer A 1ul,25 pmol primer B 1ul,7.5 pmol probe 0.3ul,500 ng/ul RNase 1ul,5U/ul AmpliTaq 0.5 ul,H2O 11.5ul)直接加入逆转录反应管中, 置PE7700型荧光定量PCR仪上扩增,循环参数为95°C 15 sec,56°C 30sec,30个循环。 1.2.4 方法的敏感性测定 取AMV逆转录酶2 ul经10倍连续梯度稀释,浓度依次为:25、25×10-1、25×10-2、25×10-3、25×10-4、25×10-5、25×10-6、25×10-7、25×10-8、25×10-9U/ul,分别取0.5ul加入PCR反应体系中,实验条件与上述反应相同。 2 结果 2.1 方法的敏感性测定结果 取AMV逆转录酶经连续梯度稀释后,经PCR循环反应,得到与理论值完全相符合的PCR荧光值曲线。当AMV逆转录酶稀释到10-8时,仍可得到相应的荧光值。详细结果见表1。阴性对照为无RT和无MS2 RNA。 2.2 500份献血员样本测定 将500份献血员血样标本,经标本处理后用我们建立的方法检测RT活性,结果有19份血样中RT活性阳性,阳性率为:3.8%。 2.3 用目前所用筛选方法与RT活性测定结果 目前我国在对献血员筛查中,普遍只对HIV、HCV和HBV进行筛查,一般不进行其他病毒类做筛查。用常规筛选方法检测500份献血员血样,有1份HIV可疑结果,有2份HCV阳性,有5份HBV阳性,共8份,筛检率为1.6%。 740)this.width=740" border=undefined> 表1 AMV逆转录酶梯度稀释后所得荧光值
AMV浓度(U/ ul) 荧光值
25 5.2×107
25×10-1 1.8×107
25×10-2 8.6×106
25×10-3 2.4×106
25×10-4 4.4×105
25×10-5 8.8×104
25×10-6 1.4×103
25×10-7 5.2×103
25×10-8 6.8×102
25×10-9 <80(检测不到荧光值)
阴性对照 <80(检测不到荧光值)
3 讨论

逆转录酶是一种依赖RNA的DNA聚合酶,是逆转录病毒特有的一类酶。研究发现,越来越多的逆转录病毒(艾滋病病毒、丙肝病毒、EB病毒、单疱病毒、巨细胞病毒、流感病毒等)能够传染人类及多种物种,引起免疫缺陷、白血病和淋巴细胞癌等。在其复制过程中,形成新的逆转录病毒DNA,整合到宿主细胞染色体中,激活或灭活细胞基因,引起突变和重组。逆转录酶是一种依赖RNA的DNA聚合酶,是逆转录病毒特有的一种酶类,逆转录酶的基因存在于某些哺乳动物和禽类。逆转录酶是所有逆转录病毒中的一个重要标志,凡是逆转录病毒中均携带逆转录酶,逆转录酶活性的高低可即时反映逆转录病毒的感染程度,而不受病毒基因序列的影响。

我们根据逆转录酶病毒所共有的逆转录酶基因设计引物及探针,经荧光标记所建立的荧光产物增强逆转录酶活性分析(STF-PERT)定量方法,对献血员血样中逆转录酶活性测定,具有较高的使用价值。研究结果发现,逆转录酶经PCR循环反应后可得到与理论值完全相符合的PCR荧光值曲线;当AMV逆转录酶稀释到10-8时,仍可得到相应的荧光值,证明具有较高的敏感性;在对献血员血样检测中发现,逆转录酶活性筛选率达3.8%,而在现用筛选方法中包括HIV、HCV和HBV总筛选率只有1.6%。因此,认为现用临床输血献血员筛选方法,并不能完全包含所有逆转录酶病毒类,可能检测不到所有检测献血员中血样中的逆转录酶活性,对及时发现逆转录病毒感染,提高临床输血安全性有着十分重要的意义。

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