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中国肾上腺脑白质营养不良患者中1个新的ABCD1基因突变的鉴定

医学检验信息网 检验医学 2007-1-29 12:35:27

肾上腺脑白质营养不良(adrenoleukodystrophy,ALD)是一种主要侵犯大脑白质、肾上腺等器官的X-连锁隐性遗传病,其主要特征是极长链饱和脂肪酸(very long chain fatty acids,VLCFA)在体内大量堆积,引起大脑白质脱髓鞘改变、肾上腺功能不全等病理改变。ALD的致病基因称为ALD基因,定位于染色体Xq28,编码ALD蛋白(ALD protein,ALDP)。ALDP属于ATP结合盒(ATP-binding cassette,ABC)转运蛋白超家族D亚家族,且其排序为第一位,故ALDP又称为ABCD1蛋白,ALD基因称为ABCD1基因。ALD的病程呈进行性发展,预后不良,尤以儿童大脑型为甚,发病后的平均生存时间仅为3年左右[1]。分子诊断作为ALD诊断的重要手段,通过RT-PCR、限制性酶切分析、PCR产物直接测序等方法和技术,能准确查出ALD患者的基因突变类型和位点。最近,我院接诊了1个ALD家系,为其进行基因突变分析,现报告如下。

1 材料与方法 1.1 研究对象 患者,陈某,男,11岁,汉族,浙江乐清市人。2年前出现视物不清、学习成绩下降、反应迟钝等临床症状,此后呈进行性加重。曾就诊于上海市华山医院,头颅MRI显示,双侧枕叶、侧脑室、三角区周围见片状异常信号影,双侧对称性分布,并沿胼胝体压部延伸呈蝶形,纵向沿纤维白质往下到脑干中脑,诊断为儿童大脑型ALD(CCALD)。患者二哥2年前因患ALD(上海华山医院诊断)死亡,患者父母体健,非近亲婚配。患者大哥现上中学,未出现类似症状。 1.2 长链RT-PCR和直接测序 采集ALD家系所有成员和无关对照的外周血,用QIAamp@ blood RNA mini kit提取全血总RNA,并反转录成cDNA。参照文献[2],先扩增ABCD1基因cDNA编码区全长,然后分4段(ALD1、ALD2、ALD3、ALD4)对ABCD1基因cDNA编码区进行扩增,其中每个片段的3’端和下一个片段的5’端部分重叠。在总反应体积50 μl中:cDNA 2 μl、引物各为30 pmol、dNTP 0.2 mmol/L、Taq DNA聚合酶5 U。反应条件:94℃ 2 min;94℃ 45 s,56℃ 30 s,72℃ 60 s,30个循环;72℃ 5 min。4对引物的退火温度分别为56℃58℃55℃55℃。PCR产物纯化后,以相应引物,委托上海博亚公司用末端终止法,在ABI 3730型DNA测序仪进行序列分析。 1.3 基因组DNA扩增和限制性内切酶分析 患者及其家系成员的外周血基因组DNA,按试剂盒(MoBio DNA Blood Isolation Kit)说明提取基因组DNA,以基因组DNA为模板,扩增ABCD1基因突变所在的局部区域(外显子2)。采用Primer 3.0软件设计PCR引物,其上游引物(PE2-84F):5’-ACTGGGAGACCC TGACCATC-3’,下游引物(PIV2163R):5’-CGAGCTCAACCTCTGAAAGC-3’。预期扩增片段大小为428 bp。PCR反应条件:94℃ 4 min;94℃ 30 s,55℃ 30 s,72℃ 45 s,30个循环;72℃ 5 min。PCR产物纯化后,根据突变的性质,采用Eco47Ⅰ对PCR产物进行酶切分析,于25 g/L琼脂糖上电泳,并在Flour-S凝胶成像仪上成像。 2 结果
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